Obecny wygląd kaplicy pw. Pana Jezusa Ubiczowanego (zmiana wezwania nastąpiła dopiero w XVII w., zapewne w związku z przekształceniem jej na mauzoleum rodzinne Kampianów) jest implikacją czterech albo pięciu etapów budowy. Wystrój plastyczny kaplicy utrzymany jest w stylu manierystycznym, jednolity stylistycznie. Wnętrze pokryto inkrustowanym brązowym marmurem zdobionym rzeźbami, kartuszami, festonami, ornamentem okuciowym i małżowinowo-chrząstkowym oraz arabeskami wykonanymi częściowo z alabastru. Ołtarz z czarnego marmuru, wykonany prawdopodobnie przez Henryka Horsta ok. 1586 r., ma dwa poziomy. W dolnej części, w polu centralnym konstrukcji, umieszczony został obraz w złotej ramie Chrystus Ubiczowany, flankowany ustawionymi we wnękach rzeźbami z czerwonego marmuru przedstawiającymi naturalnej wielkości Apostołów Piotra i Pawła. W górnej kondygnacji podziwiać można obraz Chrystus trzymający krzyż, a w niszach po dwóch jego stronach znajdują się figury św. Augustyna i św. Jana Kantego. Kondygnacje oddziela fryz z tryglifów i kartuszy. W zwieńczeniu widoczna jest płaskorzeźba ukazująca Boga Ojca.
Obie ściany wypełniają grobowce o kompozycji architektonicznej. Na ścianie wschodniej znajduje się epitafium fundatorów. Dolna część podzielona została trzema pilastrami na dwa pola arkadowe, w których umieszczone są popiersia Piotra i Marcina Kampianów z tablicami z inskrypcją. Nad nimi mieszczą się podwijane owalne kartusze z popiersiami Ewangelistów.
Łuk wypełniony jest płaskorzeźbami przedstawiającymi Ojców Kościoła. Na cokole widnieje obramowane smokami epitafium księdza Krzysztofa Kampiana. Szczyt kompozycji architektonicznej na szerokim fryzie, w którym prostokąty z różowego marmuru oddzielone są popiersiami Apostołów. Na wolutowych spływach umieszczono ptaki oraz figury alegoryczne: Miłość i Męstwo. W medalionie znajduje się obraz Pieta zdobiony po obu stronach wiązankami z kwiatów, liści i owoców. Na ścianie zachodniej rozmieszczono płyty dedykowane Marcinowi Groswajerowi i jego żonie Annie oraz Marcinowi Ostrogórskiemu i jego żonie Zuzannie z Kampianów.
